主體工程水土保持評價包括主體工程選址（線）評價、建設(shè)方案與布局評價兩個方面。
主體工程選址（線）評價
重點是依據(jù)《技術(shù)標準》第3.2.1條的“項目約束性規(guī)定”對主體工程選址（線）進行評價，給出明確的評價結(jié)論。對無法避讓的，應(yīng)提出具體的水土保持措施，盡可能降低水土流失危害。
建設(shè)方案與布局評價
建設(shè)方案的評價，主要是依據(jù)《技術(shù)標準》第3.2.2條規(guī)定，根據(jù)項目類別，進行相應(yīng)的評價。如線性工程深挖路段是否加大了橋隧比例，山區(qū)輸變電工程塔基是否采用了不等高基礎(chǔ)，城鎮(zhèn)區(qū)的建設(shè)項目是否提高了植被建設(shè)標準，無法避讓水土流失重點預防保護區(qū)和重點治理區(qū)的，是否優(yōu)化了建設(shè)方案、是否提高了截排水工程設(shè)計標準、是否提高了植物措施標準等。
工程占地評價
結(jié)合對建設(shè)方案的評價結(jié)論，依據(jù)節(jié)約用地和減少擾動的要求，盡可能優(yōu)化建設(shè)布局，尤其是在滿足施工要求的條件下，嚴格控制工程臨時占地。
土石方平衡評價
依據(jù)《技術(shù)標準》第4.3.6條的規(guī)定，從有利于水土保持的角度，對施工組織設(shè)計和施工工序進行調(diào)整，盡可能實現(xiàn)土石方挖填內(nèi)部各標段之間調(diào)運、平衡利用，并對棄方給出處置建議。
取土（料）場評價
對違反《技術(shù)標準》第3.2.3條強制性規(guī)定的，應(yīng)明確給予否定結(jié)論，并提出調(diào)整選址要求。合理設(shè)置的取土場，應(yīng)對防治措施和土地利用方式進行復核，明確水土流失防治責任，防治措施不達標的應(yīng)提出修改意見。對外購取土（料）場，應(yīng)在報告中明確其水土流失防治責任，對水土流失防治責任不明確的，應(yīng)布設(shè)防治措施并納入方案；對防治責任明確的，應(yīng)將協(xié)議作為方案的附件，加以佐證。
棄渣場評價
對違反《技術(shù)標準》第3.2.5條強制性規(guī)定的，應(yīng)明確給出否定結(jié)論，并提出調(diào)整選址要求。
對合理設(shè)置的棄渣場，應(yīng)按照《設(shè)計規(guī)范》第5.7和12.2節(jié)的有關(guān)規(guī)定，對棄土場等級、排洪工程、堆置方式、與重要基礎(chǔ)設(shè)施之間的安全防護距離、穩(wěn)定性計算和防護措施總體布置等情況進行復核。尤其是對布設(shè)于山區(qū)、丘陵區(qū)的1、2、3級棄渣場，應(yīng)重點復核地質(zhì)詳勘報告、穩(wěn)定性分析評價結(jié)論和防洪排導工程設(shè)計標準，對不符合《技術(shù)標準》和《設(shè)計規(guī)范》要求的，應(yīng)提出調(diào)整和修改、補充建議。
對布設(shè)在河道、湖泊管理范圍內(nèi)或匯水面積和流量大、溝谷縱坡陡的溝道內(nèi)的棄渣場，應(yīng)進行選址論證，必要時進行防洪評價，并采取相應(yīng)措施以確保河道行洪安全。
施工方法與工藝評價
從減少水土流失的角度，對項目施工方法與工藝進行分析和評價，尤其是有可能造成水土流失的施工環(huán)節(jié)，如是否存在不合理的工程占地、施工順序是否有利于降低水土流失、棄土（石、渣）是否做到分類堆放等。對主體工程設(shè)計中尚未明確的，應(yīng)提出水土保持要求。
主體工程設(shè)計中水土保持措施界定
對主體工程已有的水土保持措施進行界定，目的在于評價主體工程水土保持措施是否滿足水土保持要求，為補充、完善項目水土保持措施提供依據(jù)。水土保持措施的界定要與水土保持措施的評價結(jié)合進行，可依據(jù)《技術(shù)標準》附錄D先對主體工程中的水土保持措施進行功能性界定。
主體設(shè)計中具有水土保持功能工程的評價
對主體設(shè)計中具有水土保持功能工程進行評價，是編制水土保持方案的重要一環(huán)，可以減少不必要的重復投資。在水土保持措施功能性界定成果的基礎(chǔ)上，依據(jù)《設(shè)計規(guī)范》進行定量評價，包括復核工程設(shè)計標準、水文水力計算、設(shè)計斷面等內(nèi)容，不滿足要求的，提出補充完善意見；滿足要求的，納入項目水土保持方案工程總投資，列表說明工程位置、類型、工程量和投資，并附相關(guān)工程主體設(shè)計圖。
